神经电生理室成立于2013年，由脑电图、经颅多普勒（TCD）、肌电图三个科室组成。现位于北区门诊六楼，有脑电图、经颅多普勒（TCD）两个科室；位于南区门诊三楼北侧，有肌电图、经颅多普勒（TCD）两个科室；位于南区门诊三楼南侧有耳石仪器复位仪。科室共有9人，副主任医师一名，中级职称四名，技师三名，医师一名。其中二人北大医院神经内科进修，一人安徽医科大学附属医院肌电图进修，二人蚌埠医学院附属医院脑电图进修。

神经电生理检查是神经系统查体的延伸，脑电图对癫痫，脑炎的诊断，其中对癫痫诊断是不可替代的；经颅多普勒（TCD）开展了对脑血管疾病的筛查，包括颅内血管狭窄，再通，代偿；外伤，蛛网膜下腔出血后血管痉挛。2021年5月，在北大医院神经内科彭清主任的指导下，开展了TCD发泡试验。肌电图对周围神经病变，常见的卡压综合征，神经根，神经肌肉接头病变，肌肉病变的诊断是非常有意义的。2021年12月，在耳石手法复位的基础上，开展耳石复位仪器治疗，对眩晕患者更好的检查，治疗。